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新疆五家渠地区鱼类水霉病病原菌18S,rDNA序列系统分类分析

材料写作网    时间: 2020-08-12 05:01:46     阅读:


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摘要:在对新疆五家渠地区15株鱼类水霉病病原菌18S rDNA克隆测序的基础上,探讨相比传统分类方法,运用18S rDNA序列进行分子鉴定对水霉菌分类的可行性。结果显示,用MEGA 5.0软件构建邻接(NJ)树和最大似然(ML)树进行分类,15株病原菌中LF04、LF01、JX03、JX01为寄生水霉,HL04、JY07、HZ、JY10、LY04、JY15、HL01为镰刀菌,JX02为腐霉,JY06未鉴定出结果,与形态学分类结果差异巨大。

关键词:水霉病;系统发育树;分类;18S rDNA

中图分类号: S941.43+1

文献标志码: A

文章编号:1002-1302(2019)15-0194-06

水霉病(saprolegniasis)又称肤霉病、白毛病,是威胁淡水鱼类养殖的世界性病害,在很多淡水鱼的成鱼、鱼苗、鱼卵中都会发病。水霉病的病原目前已发现有几十种,主要是真菌门鞭毛菌亚门藻状菌纲水霉目水霉科的水霉属和绵霉属以及霜霉目腐霉科的腐霉属和疫霉属[1-3],宿主一般在受伤之后易感染水霉病[4]。水霉病病原菌通常具有一些真菌特征,但其作为非真菌的类真菌生物,对于其分类地位尚存争议[5]。目前,随着分子生物学的快速发展,许多分子生物学手段已用于水霉的分类学研究[6-10]。内转录间隔区(ITS)区域与18S rDNA因其高度保守且种间甚至种内高度变异被广泛应用于真菌种间分析和种的鉴定。新疆独特的气候特点使鱼类在经历严冬后的初春易患水霉病,鱼类水霉病的病情较我国其他地区更为严峻,而目前未见相关研究,因此对新疆地区鱼类水霉病病原菌的分离鉴定十分必要。

对于初学者而言,构建邻接(NJ)树和最大似然(ML)树,一般采用MEGA软件[11]。MEGA是Nei开发并设计的图形化软件,使用方便快捷。本研究以新疆五家渠地区分离纯化所得15株水霉病病原菌18S rDNA区域为分子标记,进行分子生物学鉴定,并与形态学的鉴定结果作对比,以期弥补国内水霉分类研究的不足,并为鱼类水霉病的病原鉴定及后期药物防治的研究提供数据。

1 材料与方法

1.1 试验材料

菌种:由笔者所在实验室早期分离纯化(于2010”2017年自新疆五家渠市水产养殖基地采样,带回实验室分离纯化菌种并进行形态、18S rDNA测序分析等相关试验)获得并进行形态学初步鉴定。其中,HL01、HL02和HL0...

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