鸡消化道微生物菌群的组成及作用机理
摘 要：自发现了可以研究动物肠道微生物的技术以来，家禽消化道的微生物菌落一直是人们研究的对象。对于肠道微生物菌群的营养和生理需求，我们所掌握的知识很有限，仅限于了解可以在实验室条件下轻易培养的那些菌种。在分子技术得到运用之前，这些结果掩盖了鸡肠道微生物菌群的真实组成及其行为，这些分子技术包括聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）、变性梯度凝胶电泳（Denaturing Gradient Gel Electrophoresis，DGGE）、末端限制性片段长度多态性（Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism，T-RFLP）分析、克隆和测序等方法。当DNA测序技术变得更为廉价且耗时更少时，人们对肠道微生物菌群实际组成的研究取得了重大进展。研究人员揭示了肠道微生物菌群（包括未经培养的微生物）的真实组成，并提出了其在鸡生理学中作用的新见解。本文我们将讨论家禽肠道微生物菌群组成及其对肠道内环境稳定以及肠道发育、分化和成熟的影响。此外，我们还将介绍改变肠道微生物菌群组成会怎样改善营养物质的吸收和怎样改变可以影响肠道功能的黏蛋白层组成。学术界在这方面已经取得了重大研究进展，未来的研究是要阐明肠道微生物对家禽生理的影响机制。未来家禽生产上的发展将包括专为获得特定作用设计的微生物调节剂。
关键词：微生物菌群；微生物区系；微生物组；肠道；全息生物；体内平衡；分化；黏蛋白；益生素
中图分类号：S811.6 文献标志码：C 文章编号：1001-0769（2018）05-0047-03
1 重要性
'共生生命体（holobiont）“是为描述由片利共生和互利共生以及宿主相关微生物菌群组成的脊椎动物超有机体创造的术语（Singh等，2013b；Walter等，2013）。宿主要发挥出其最大的遗传潜力可能需要肠道微生物菌群之间的完美平衡，事实上似乎任何一种脊椎动物都可能拥有共同进化的基因组和它的微生物组（Xu和Gordon，2003）。例如，肠道微生物菌群在肠道内构建了一个会对宿主的许多机体功能产生影响的复杂环境。这些微生物对动物机体的影响包括黏蛋白的降解、控制病原体的丰度和行为、调节炎症以及刺激肠道的分化和发育，等等。在食品生产用动物的生产中，用于操控肠道微生物菌群的策略有很多，其目的都是影响营养物质的消化和吸收。另外，动物抵抗人畜共患病病原体的感染和定植的能力可能会受到肠道微生物菌群的影响。增加肠道有益微生物丰度的常用方法包括使用直饲型微生物（如益生菌）和益...
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