基于16S,rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究
摘要
利用Illumina HiSeq技術，对赤壁、大悟、武汉、咸安和英山5个茶园小贯小绿叶蝉地理种群的成虫共生细菌16S rDNAV4变异区进行测序，应用Uparse和RDP Classifier等软件统计和分析样本的物种组成、丰度和多样性。5个地区小贯小绿叶蝉成虫的16S rDNA基因序列文库共获得239 645条有效tags，在97%相似阈值下将其聚类为3 403个OTUs。共注释到41个门，116个纲，197个目，272个科，372个属，105个种。5个样本的共生菌在不同分类水平上的组成有所不同，其中在门水平上，主要优势菌为变形菌门Proteobacteria（相对丰度60.6%～97.1%）；在纲水平上，相对丰度排名前5位中共有的优势菌为γ变形菌纲Gammaproteobacteria和α变形菌纲Alphaproteobacteria；在属水平上，排名前10位中5个样本共有的优势菌为盐单胞菌属Halomonas、希瓦氏菌属Shewanella和沃尔巴克氏体属Wolbachia。小贯小绿叶蝉成虫细菌的Chao指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数分别为1 065.55～2 841.89，1 130.76～2 914.90，1.07～8.63和0.18～0.99。茶园小贯小绿叶蝉成虫共生细菌多样性比较丰富，不同地理种群的小贯小绿叶蝉细菌群落结构和多样性有差异。本研究结果为进一步研究细菌对小贯小绿叶蝉种群生物学的影响奠定了基础。
关键词
小贯小绿叶蝉； 细菌； 16S rDNA； 多样性
中图分类号：
S 433.39
文献标识码： A
DOI： 10.16688/j.zwbh.2017347
Analysis of the bacterial diversity in adults of Empoasca （Matsumurasca）
onukii based on 16S rDNA sequences
MAO Yingxin1， TAN Rongrong1， WANG Youping2， CHEN Xun1，
WANG Hongjuan1， Huang Danjuan1， GONG Ziming1
（1. Institute of Fruits and Tea， Hubei Academy of Agricultural Sciences， Wuhan 430064， China；
2. Institute of Plant Protection， Soil and Fertilizers， Hubei Academy of Agricultural Sciences； Key Laboratory of
Integrated Pest Management of Crop Pests in Central China， Ministry of Agriculture，Wuhan 430064， China）
Abstract
The V4 regions of the 16S rDNA of symbiotic bacteria in adults of Empoasca （Matsumurasca） onukii from five geographi...
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