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蛋白质组学研究概况及其在食用菌研究中的应用

材料写作网    时间: 2020-09-18 04:05:32     阅读:

随着后基因时代即功能基因组时期的来临,研究蛋白质的科学蛋白质组学(protoemics)应运而生[1,2]。 'proteome“(蛋白质组)一词由澳大利亚学者WILKINS 于1995 年首次提出,其含义是指一个基因组、一种生物或一种细胞/ 组织所表达的全套蛋白质[3,4]。从此,蛋白质组学得到了空前的发展,相关技术的研究也取得了重大突破[5,6]。蛋白质组学(proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组学(genomics)两个词[7 ]。它采用大规模、高通量、高灵敏度的技术手段,通过全局性研究基因组所表达的所有蛋白质在不同时间与空间的表达谱和功能谱,全景式地揭示生命活动的本质[8]。由于其反映了蛋白质的动态本质,更有利于揭示机体对内外界环境变化产生反应的本质规律,因此蛋白质组学引起研究者的广泛关注。

1 蛋白质组学主要研究方法

蛋白质组学的相关技术包括分离技术、鉴定技术、相互作用技术、生物信息学等。分离技术主要是二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis, 2-DE); 鉴定技术主要有 Edman降解法测N端序列、质谱(mass spectrometry)技术、氨基酸组成分析、蛋白质芯片(protein chip)技术;相互作用技术主要有酵母双杂交系统、表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)技术等[9]。

双向凝胶电泳和质谱技术是当前分离鉴定蛋白质的两大支柱技术,它们的结合是现代蛋白质组学研究的基础。双向电泳技术是 O’FARRELL 于 1975年建立的用于分析蛋白差异表达的研究技术[10],能高分辨、高灵敏地展示各种因素引起的两个样品间的蛋白差异[11]。双向电泳的基本原理是:第一向电泳为等电聚焦(IEF),按蛋白质等电点进行分离;第二向电泳为 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),按亚基分子量大小进行分离;经过两次分离,蛋白以点的方式得到最优分离[12]。质谱技术的基本原理是样品离子化后,根据不同离子间的质荷比(m/z)差异来分离并确定分子量。该技术因具有高灵敏度、高通量及自动化等特点,从而能与蛋白质组大规模研究相适应,逐渐成为一种鉴定蛋白质的精确手段[13]。

2 蛋白质组学在食用菌研究中的应用

蛋白质组学研究已经应用于食用菌领域。虽然蛋白质组学在食用菌的研究中起步较晚,但也取得了一定的研究成果,本文就国内外的研究现状做一介绍。

2.1国内研究

2007年中国科学院沈世华等,采用双向电泳和质谱技术研究牛肝菌(Boletus edulis)在4%Na...

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