烟草蛋白酶体α2型亚单位的克隆和序列分析
摘要：为研究烟草识别病毒并将其降解为蛋白酶体基因，以拟南芥的蛋白酶体α2型亚单位基因全长cDNA序列（GenBank登录号：AF043520.1）为信息探针，用电子克隆的方法从烟草栽培品种中克隆到1个蛋白酶体基因NtPAB1，并对其进行序列分析。结果表明，NtPAB1包含完整的开放读码框，编码219个氨基酸，含有1个保守域proteasome_alpha_type_2；通过同源比对和进化分析发现，NtPAB1氨基酸序列与葡萄PAB1的序列一致性达到98%。以上结果表明，NtPAB1是栽培烟草中未报道的编码蛋白酶体基因。
关键词：栽培烟草；蛋白酶体α2型亚单位；蛋白降解；克隆；序列分析
中图分类号： S188；S572.01 文献标志码： A
文章编号：1002-1302（2016）09-0039-03
马铃薯Y病毒属的蚜传辅助因子（HC-Pro）是释放感染所需病毒蛋白的三大蛋白酶之一[1]，HC-Pro抑制植物体内起抗病毒作用的RNA干涉，但其具体分子机制尚无报道[2-3]。近期研究发现，莴苣花叶病毒的HC-Pro能干涉泛素/26S蛋白酶体系统中核心元件20S蛋白酶体的活性，而泛素/26S蛋白酶体系统参与抗病毒反应[4]。Ballut等研究发现，烟草花叶病毒、莴苣花叶病毒的RNA能够被蛋白酶体识别水解，这暗示20S蛋白酶体的核酸内切酶活性可能参与植物体内的抗病毒过程[5]。
泛素/26S蛋白酶体在植物发育的方方面面起着重要作用，影响着一系列生理过程，包括胚胎发育和衰老[6]。泛素/26S蛋白酶体的核心元件是受到紧密调控并高度特异的26S蛋白酶体，由二级结构为圆柱形的20S核心蛋白酶结合1个19S调控因子构成[7]。筒形的20S蛋白酶体由4个环形结构构成，包括在2个外侧的环形结构中的7个α亚基，而内侧的2个环形结构上具有7个β亚基，其大体的构型为α1-α7/β1-β7//β1-β7/α1-α7/α1-α7[7]。尽管已经从烟草、土豆、绿豆、豌豆等植物中纯化得到20S蛋白酶体[8-10]，但是目前尚无关于栽培烟草中蛋白酶体α2型亚单位基因序列的报道。
随着近年来多...
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