遗传的印记

材料写作网    时间: 2020-09-20 04:05:32     阅读:次

2014年12月12日，国际著名病原学期刊《科学公共图书馆-病原》（PLOS Pathogens）在线发表了中国科学技术大学吴清发教授研究团队与中国农业科学院植物保护研究所李世访研究员研究团队合作的研究成果””在苹果锈果病样品中发现一种新的具有核酶活性的环状RNA的最新成果。这一突破性发现引起了业界学者专家和各大媒体的高度关注，而吴清发教授和他近年一直从事的基因组学和生物信息学研究，也从幕后走到了台前。

探寻环状RNA的真面目

一直以来，被称作苹果锈果病的严重病害困扰着果农。一旦苹果树被感染后，果实就会出现锈果、开裂或花斑等症状，影响果实质量。上世纪80年代，在研究苹果锈果病时，中国农业科学院兴城果树研究所的果树病毒专家刘福昌研究员和日本果树病毒专家小金泽硕城均从苹果中分离到一种关键遗传物质””特殊环状RNA。但是，限于检测及分析技术的限制，一直未能揭示出它的真面目。

植物病毒和类病毒在植物体内复制时，会形成双链RNA的特殊核酸分子，这种核酸分子可被植物细胞内的防御蛋白Dicer识别，产生长度为21-24碱基的siRNA。应用最新测序技术对植物的所有的小RNA测序，然后对测序数据进行生物信息学分析，可以获得植物病原体的信息。在传统的研究中，科学家所依赖的生物信息学工具主要是序列同源比对方法，对获得的数据进行分类和功能预测，鉴定出与已知病原体遗传物质具有一定同源性的新病原体序列，但对和已知序列没有同源性的序列进行分类和功能预测仍然是目前生物信息学研究的难点。

植物类病毒的遗传物质是特殊的RNA分子，在感染植物细胞中后可产生大量的相互重叠的来源该RNA分子的siRNA。吴清发研究组从2010年开始开发生物信息学鉴定发现新类病毒的PFOR算法，这种算法不依赖于已知...

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