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宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用

材料写作网    时间: 2020-03-15 06:50:39     阅读:

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  摘要:近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病毒鉴定的主要技术之一。本文总结了基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的主要方法,详细综述了鉴定技术的实现流程,评述了几种基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的优缺点,并对基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的未来发展方向进行了展望。
  关键词:水产动物病毒;宏基因组学;病毒鉴定;二代测序
  中图分类号:s941.41 文献标识码:A 文章编号:1000-4440(2019)01-0229-09
  中国水产养殖产业飞速发展,最近29年产量一直居世界第一。据《2016年全国渔业经济统计公报》显示,2016年中国水产品总产量达到6.9x10(7)t,其中养殖水产品产量5.1×10(7)t,,占水产品总产量的74.5%。据联合国粮食及农业组织《世界渔业和水产养殖2016》报道,中国的水产养殖产量占全球水产养殖产量的60%以上。然而,近些年来世界各国都遭遇到一个制约水产品产业发展的严重问题,即水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重。针对这一挑战,世界各国病毒学家都对水产动物病毒的研究给予了高度重视,并获得了大量的研究成果。目前已从养殖和野生水生动物中鉴定出包括虹彩病毒、呼肠孤病毒、弹状病毒、疱疹病毒和双RNA病毒等不同病毒。尤其是近年来,随着二代和三代测序组测序技术的发展,已经获得了许多水产动物病毒的全基因组序列,这给水产动物病毒的深入研究打下了良好的基础。
  宏基因组学(Metagenomics)是通过直接从环境样品...

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