红枣中链格孢菌的多重PCR检测
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摘要:为快速、灵敏并且特异性地检测红枣中链格孢菌,选取2对链格孢菌特异引物,优化多重PCR检测中的引物比例、退火温度、dNTP浓度及Mg2+浓度等条件,结果表明多重PCR扩增出了预计的链格孢菌PCR产物,优化的条件为Alt-F2\R2 ∶Alt-F1\R1=3 ∶1、退火温度52 ℃、dNTP浓度0.05 mmol/L、Mg2+浓度1.5 mmol/L。该方法在检测红枣链格孢菌中具有很好的应用和开发前景。
关键词:红枣;链格孢菌;多重PCR;检测
中图分类号: TS207.4 文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2016)09-0301-02
红枣(Zizyphus jujuba Mill.)是集营养、保健于一体的优质干果,含有丰富的多糖、维生素C、黄酮、cAMP等成分[1-2],但红枣在自然条件下贮藏容易发生真菌病害侵染引起的霉变,在霉变过程中,真菌产生的二次代谢产物真菌毒素具有很强的毒性,会给食用者带来危害[3-4]。近年来的研究表明,链格孢菌是红枣霉变中的主要真菌之一[5-7],因此对其进行快速准确地检测,对控制红枣产品的安全性具有重要意义。
多重PCR检测技术具有快速、简便且特异性的优点,在许多植物真菌的检测中得到广泛应用[8-10],但对枣中链格孢菌的多重PCR检测尚未见报道。本研究针对枣中链格孢菌特菌Alt-F1\R1扩增片段和Alt-F2\R2扩增片段设计引物,采用多重PCR对其进行鉴定,研究其多重PCR检测条件,旨在为枣产品的链格孢菌检测提供一种新方法。
1 材料与方法
1.1 材料
Tap酶、dNTP,均购自TaKaRa公司;真菌DNA提取试剂盒,Omega公司;5311型PCR仪,德国Eppendorf公司;LPH恒温培养箱,上海鸿都电子科技有限公司。
1.2 方法
1.2.1 病原真菌总DNA的提取 将霉变红枣上刮下的菌丝洗涤、干燥,液氮研磨后转移至EP管中,使用试剂盒提取基因组DNA作为PCR反应的模板,0.8%琼脂糖凝胶电泳法检测DNA。
1.2.2 链格孢菌引物单重PCR特异性试验 根据序列比对结果,选取2对链格孢菌的特异引物:
Alt-F1:5′-TGTCTTTTGCGTACTTCTTGTTTCCT-3′;
Alt-R1:5′-CGACTTGTGCTGCGCTC-3′;
Alt-F2:5′-CTTTTGCGTACTTCTTGTTTCC-3′;
Alt-R2:5′-CAGGCATGCCCTTTGGATAC-3′。
其中:Alt-F1、R...
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