洋葱不同组织RNA提取方法比较分析
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2016.10.022
摘要:探讨洋葱不同组织总RNA提取的最优方法,以期为今后开展洋葱的分子生物学研究奠定基础。以洋葱品种W470发育旺盛时期的叶片、根、鳞茎为材料,比较TaKaRa试剂盒法、TIANGEN试剂盒法、TRIzol法、pBIOZOL法等4种RNA提取方法提取洋葱RNA的效果。凝胶电泳结果显示,除了TIANGEN试剂盒法不能提取洋葱根的总RNA,其他方法在洋葱不同组织中均可提取到不同质量的RNA。对不同方法提取洋葱RNA浓度、纯度进行检测发现,TaKaRa试剂盒法提取洋葱叶片的总RNA浓度为342.31 μg/g,pBiozol法提取洋葱鳞茎、根的总RNA浓度分别为 1 119.39、171.85 μg/mL。经RT-PCR验证,TaKaRa试剂盒法提取的洋葱叶片总RNA、pBIozol法提取洋葱鳞茎、根的总RNA均成功扩出洋葱β-actin基因片段。由结果可知,TaKaRa试剂盒适合提取洋葱叶片的总RNA,pBIOZOL法适合提取洋葱鳞茎、根的总RNA且质量能够满足后续试验要求。
关键词:洋葱;总RNA;RNA提取;RT-PCR
中图分类号:S633.201 文献标志码:A文章编号:1002-1302(2016)10-0095-03
收稿日期:2015-09-11
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(编号:200903018)。
作者简介:张仕林(1989”),男,四川广元人,硕士研究生,研究方向为洋葱遗传育种与分子生物学。E-mail:709744424@qq.com。
通信作者:王建军,硕士,副教授,主要从事洋葱遗传育种研究。E-mail:wangjianjun@njau.edu.cn。洋葱(Allium cepa L.)为百合科葱属2年生蔬菜,在我国已广泛栽培,并作为主要的出口蔬菜品种之一[1]。洋葱不仅可以作为蔬菜和调味品,而且因其糖类、硫化物含量丰富,从而具有降'三高“、降低和预防血栓形成风险以及预防心肌梗塞等功效。此外,洋葱还含有特殊的营养物质槲皮素,能抑制癌细胞活性、阻止癌细胞生长、预防癌症[2]。
RNA是一种重要的遗传信息分子,提取高质量...
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