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脉冲场凝胶电泳技术在致病菌分型技术的应用

材料写作网    时间: 2020-09-22 04:05:50     阅读:

[摘要] 脉冲场凝胶电泳(pulse-field gelelectrophoresis,PFGE),又称脉冲式交变电场电泳,该技术是将电泳电场方向交替性改变,并优化脉冲时间和其他条件,可以分辨凝胶中35~10 000 kb的DNA分子。该方法应用于分子流行病学中,通过观察电泳条带的差异,为确定菌株之间的亲缘关系提供了可靠的技术手段。该技术在致病菌溯源(细菌性传染性疾病溯源、细菌性食源性疾病溯源)、医院内感染流行监测等方面都有广泛的应用。

[关键词] 脉冲场凝胶电泳;致病菌分型;致病菌溯源;院感监测

[中图分类号] R378 [文献标识码] A [文章编号] 1672-5654(2015)08(b)-0186-04

[Abstract] Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) is a new technique of gelelectrophoresis developed in1980"s. It can be used to separate large DNA molecules ranging from 35 to10 Mb. It has been widely applied to the pathogen molecular typing , identification of species groups ,Source-tracking of pathogen and nosocomial infection surveillance.

[Key words] PFGE;Pathogen molecular typing;Traceability pathogens;Hospital infection surveillance

脉冲场凝胶电泳(pulse-field gelelectrophoresis,PFGE),又称脉冲式交变电场电泳,是上世纪80年代后期发展起来的一种新型的电泳技术,主要用来分离大分子量线性DNA。传统的琼脂糖凝胶电泳技术仅能分离50 kb以下的DNA分子,对于超过50 kb的DNA分子,传统的琼脂糖凝胶其分子筛作用较弱,无法清晰分辨电泳条带[3]。脉冲场凝胶电泳技术突破了该瓶颈,很好地解决了这一问题。1984年,Schwartz和Cantor首次将脉冲场凝胶技术应用于染色体DNA的分离,并成功分离到16条完整的酿酒酵母菌细胞染色体DNA。此后该技术得到了长足的发展,到目前为止,PFGE技术已经可以分离高达10 Mb级DNA分子[4]。

PFGE技术因其所具备的高分辨能力,其应用范围不断扩大,几乎覆盖所有生物基因组结构的研究。国内开始应用脉冲电场凝胶电泳技术最早应用于研究鼠疫耶尔森菌[5],可见脉冲电场凝胶电泳技术在致病菌分型上有其独特的优势,适于推广应用。近年来,该技术不断成熟,特别是限制性内切酶的应用,使其成功应用于菌株亲缘关系的分析。通过对检测仪器、试剂、操作程序进行标准化设置,可以建立一套重复...

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