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芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析

材料写作网    时间: 2020-08-13 05:48:52     阅读:


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摘 要 采用3′RACE和RT-PCR技术克隆芒果核苷二磷酸激酶基因全长cDNA序列,并用实时荧光定量PCR分析该基因的表达模式。结果表明:MiNDPK1基因cDNA全长1 019 bp,开放閱读框为447 bp,编码148个氨基酸。MiNDPK1蛋白定位于细胞质,无信号肽和跨膜区域,具有典型的核苷二磷酸激酶活性结构域和其他磷酸化活性位点;与麻疯树、橡胶树同源性最高为89%,与菠菜同源性最低为82%。MiNDPK1在芒果各组织中均有表达,以叶片中表达最高,其次是花和果皮;在芒果进入生殖时期的花芽分化期表达量最高,此后在芒果果实发育进程中逐渐降低并趋于平稳。结合病害处理转录组样本中的差异性表达结果,推测芒果MiNDPK1基因在花芽分化进程、抗病性诱导及免疫应答通路上发挥重要作用。

关键词 芒果;核苷二磷酸激酶;基因克隆;生物信息学分析;表达分析

中图分类号 S667.7 文献标识码 A

核苷二磷酸激酶(Nucleoside diphosphate kinase,NDPK)是一种保守性多功能蛋白,其首要功能是依靠该酶上一保守的组氨酸残基介导催化二磷酸核苷(Nucleoside diphosphate,NDP)和三磷酸核苷(Adenosine triphosphate,ATP)之间的磷酸基团转移反应来维持生命体细胞内ATP和NTP等浓度的平衡[1],参与UTP和GTP生物合成过程,在生物体新陈代谢方面起重要作用。NDPK蛋白由Berg等[2]于1953年发现以来,主要在人和动物领域研究较为深入,植物中研究较晚,但其普遍存在于原核、真核生物中,并多数以四聚体的形式存在于原核生物中,而在真核生物中却以六聚体形式存在;已有研究结果认为,NDPKs基因是一种古老基因,并以家族的形式存在,定位于细胞溶质、细胞核、线粒体及叶绿体中,是一种分泌蛋白。人类基因组中存在8个NDPKs基因(NDPKH1-NDPKH8),植物中发现的主要有NDPK1-4四个类型(拟南芥、水稻),而支原体等部分微生物不存在NDPKs基因,但多数物种存在至少一种NDPK基因[3]。

随着研究的深入,NDPKs被看作是一种'管家酶“,主要功能是维持NDP和NTP代谢平衡[1]。NDPK以其具有催化磷酸基团转移为基础的功能,在动物中不同细胞环境发挥特异性功能,起着控制细胞增殖、调控转录[4]、蛋白质磷酸转移[5-7]、DNA修复损伤[8]、细胞分化[9]、细胞的移动[1...

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