烟草泛素激活酶E1蛋白序列的分析
摘要 采用SMART、TargetP和MrBayes工具对烟草泛素激活酶E1成员的结构域、亚细胞定位和进化树进行分析。结果显示，NtUAE1、NtUAE2和NtUAE3均含有E1_FCCH、E1_4HB、UBA_e1_thiolCys、UBA_e1_C和ThiF结构域，且NtUAE2和NtUAE3含有信号肽；泛素激活酶E1各成员均定位于细胞质中发挥作用，其可靠性级别为1；烟草泛素激活酶E1的进化程度与葡萄、辣椒存在一定的差异。
关键词 烟草；泛素激活酶E1；蛋白序列
中图分类号 S188 文献标识码 A
文章编号 0517-6611（2019）09-0103-02
doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2019.09.030
Abstract SMART，TargetP and MrBayes tools were used to analyze the domain，subcellular localization and phylogenetic tree of tobacco ubiquitinactivating enzyme E1 members.The results showed that NtUAE1，NtUAE2 and NtUAE3 all contained E1_FCCH，E1_4HB，UBA_e1_thiolCys，UBA_e1_C and ThiF domains，and NtUAE2 and NtUAE3 contained signal peptides；all members of ubiquitinactivating enzyme E1 were localized in the cytoplasm and their reliability level was 1；the evolution of tobacco ubiquitinactivating enzyme E1 was somewhat different from that of grapes and peppers.
Key words Tobacco；Ubiquitinactivating enzyme E1；Protein sequence
烟草属于自花授粉植物，而泛素激活酶E1对于烟草自花授粉过程具有一定的影响[1-2]，因泛素激活酶E1被高能活化后，促使羧基末端Glyof泛素和Cys残基形成硫酯键[3]，然后与相应的蛋白结合，被26S蛋白酶体读取，并将其降解[4-6]，进而影响花粉的萌发、生长以及变形[7]，此外，泛素激活酶E1可以指导其自身的ATP依赖性而与遍在蛋白形成硫醇酯键[8]，进而发挥作用。关于泛素激活酶E1已在酵母和小麦中进行了研究[9-10]，为此，笔者对烟草泛素激活酶E1蛋白序列进行研究，以期对烟草泛素激活酶E1进行了解。
1 材料与方法
1.1 烟草泛素激活酶E1蛋白序列的获取
利用NCBI[11-12]数据库，提取草烟泛素激活酶E1的蛋白序列，登录号依次为NP_001312347、NP_001312902和CAA71762，并分别对其进行命名NtUAE1、NtUAE2和NtUAE3[13]。
1.2 方法 运用SMART、TargetP和MrBayes分析工具[14-16]，对...
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